Associations of genotype variants of single nucleotide polymorphism of gene orosomucoid-1-like-protein 3 and atopic diseases in children

Dytiatkovsky, V.O. and Abaturov, O.E. and Naumenko, N.V. and Pinayeva, N.L. and Alifirenko, O.O. (2019) Associations of genotype variants of single nucleotide polymorphism of gene orosomucoid-1-like-protein 3 and atopic diseases in children. Медичні перспективи, Т. 24 (№ 3). pp. 67-73. ISSN 2307-0404

[img]
Preview
Text
orosomucoid-1-like-protein 3_Med_pers_2019_3_67-73.pdf

Download (293kB) | Preview

Abstract

The paper presents data of the firstly conducted in Ukraine own study of associations of the single nucleotide polymorphism (SNP) rs7216389 of orsomucoid-1-like protein 3 gene (ORMDL3) variants’ with atopic diseases in children. Aim: to detect clinical significance of the SNP rs7216389 ORMDL3 in genesis of atopic diseases in children. We examined 153 children aged 3 to 18 years. The main group consisted of 119 children with clinical manifestations of atopic diseases with elevated total serum immunoglobulin E, confirmed by immunofluorescence assay method. The comparison group consisted of 34 children with a non-aggravated individual or family allergic anamnesis in whom there was detected the absence of any clinical syndromes and symptoms of atopic diseases and, mostly, physiological parameters of the serum total immunoglobulin E by immunofluorescence assay method. All the children were genotyped by ORMDL3 gene using polymerase chain reaction in real time with a restricted fragment length polymorphism. The genotype T/T within SNP rs7216389 of ORMDL3 gene significantly prevails among the children with atopic diseases and is associated with an increased incidence risk of seasonal allergic rhinoconjunctivitis (SARC) by 4.11 times (95% CI 1.55; 16.61), perennial allergic rhinitis (PAR) by 5.07 times (95% CI 1.22; 13.90) times and bronchial asthma (BA) by 10.31 times (95% CI 2.50; 42.62). Children with genotype T/T in locus rs7216389 of the ORMDL3 gene are the increased risk group for developing the atopic diseases. Children with genotype C/C in locus rs7216389 of the ORMDL3 gene are the decreased risk group for the development of atopic dermatitis. У статті наведені дані вперше проведеного в Україні власного дослідження асоціацій однонуклеотидного поліморфізму (SNP) rs7216389 гена орсомукоїд-1-подібного білка 3 (ORMDL3) з атопічними захворюваннями в дітей. Мета: визначити клінічне значення SNP rs7216389 гена ORMDL3 в розвитку атопічних захворювань у дітей. Нами обстежено 153 дитини віком від 3 до 18 років. Основну групу представили 119 дітей з клінічними проявами атопічних захворювань та підвищеним рівнем загального сироваткового імуноглобуліну Е, підтвердженим методом імунофлюоресцетного аналізу. Групу порівняння склали 34 дитини з необтяженим індивідуальним чи сімейним алергологічним анамнезом, у яких була визначена відсутність будь-яких клінічних синдромів та симптомів атопічних захворювань. Усім дітям проведено генотипування гена ORMDL3 методом полімеразної ланцюгової реакції в реальному часі з рестриктивним фрагментом довжини поліморфізму. Генотип Т/Т SNP rs7216389 гена ORMDL3 достовірно переважає серед дітей з атопічними захворюваннями та асоційований з підвищеним ризиком захворюваності на сезонний алергічний ринокон’юктивіт у 4,11 раза (95% ДІ 1.55;16.61), цілорічний алергічний риніт у 5,07 раза (95% ДІ 1.22; 13.90) та бронхіальну астму в 10,31 раза (95% ДІ 2.50; 42.62). Діти з генотипом T/T SNP rs7216389 гена ORMDL3 є групою підвищеного ризику розвитку атопічних захворювань.

Item Type: Article
Additional Information: https://doi.org/10.26641/2307-0404.2019.3.181882
Uncontrolled Keywords: atopic diseases, children, genotype, associations, orsomucoid-1-like protein 3; атопічні захворювання, діти, генотипи, асоціації, орсомукоїд-1-подібнй білок 3; атопические заболевания, дети, генотипы, ассоциации, орсомукоид-1-подобный белок 3.
Subjects: Clinical Immunology and Allergology
Pediatrics
Divisions: Departments > Department of Pediatrics 1 and medical genetics (formerly - Faculty Pediatrics and Medical Genetics)
Depositing User: Елена Шрамко
Date Deposited: 15 Jan 2020 08:17
Last Modified: 15 Jan 2020 08:17
URI: http://repo.dma.dp.ua/id/eprint/4781

Actions (login required)

View Item View Item