The level of expression of miR-196a in patients with chronic viral hepatitis C with the first genotype of HCV according to previous experience of antiviral therapy

Shostakovych-Koretskaya, L.R. and Shevchenko-Makarenko, O.P. and Lapikova-Bryhinska, T.Yu. (2020) The level of expression of miR-196a in patients with chronic viral hepatitis C with the first genotype of HCV according to previous experience of antiviral therapy. Медичні перспективи=Medicni perspektivi, Т. 25 (№ 2). pp. 130-137. ISSN 2307-0404

Text The level of expression of miR-196a .pdf Download (367kB)

Abstract

The authors present the study of the level of expression of miR-196a in 74 patients with chronic viral hepatitis C with the 1st genotype of HCV, based on previous experience in patients with antiviral therapy regimens containing interferon. The patients were divided into two groups, depending on the previous experience of antiviral therapy with circuits containing interferon – 21 patients who failed after antiviral therapy regimens containing interferon (group 1) and the comparison group (group 2) – 53 naive patients. To study the level of expression of miR-196a (miR-196a), a two-stage study according to the manufacturer's protocol was used. First, total RNA was isolated from the plasma by the method of phenol-chloroform extraction. Futher reverse transcription was performed using a kit for reverse transcription of miR TaqMan® (Applied Biosystems, USA), specific loop primers to achieve mature miRNA, snRNA U6 (as an endogenous control gene), and 10 ng of total RNA. Real-time quantitative PCR was performed using TaqMan® miRNA analysis. In order to optimize the prediction of response to antiviral therapy and the use of optimal treatment regimens for problem patients with treatment failure regimens containing interferon, analysis using ROC curves was used. The average level of expression of miR-196a in patients with chronic hepatitis C was evaluated. In the 1st group of patients it was 0.011 (IQR: 0.002; 0.310) and in the comparison group – 0.346 (IQR: 0.054; 1.239) at p=0.012 by U criterion. The conducted ROC analysis showed that the studied miR-196a could differentiate patients with chronic viral hepatitis C with HCV genotype 1, depending on previous experience of antiviral therapy, namely, patients with treatment failure regimens containing interferons and naive. AUC=0.688 (95% CI 0.570-0.791; p=0.017), J=0.40, Se=57.14%, Sp=83.02%. It gives additional opportunities for correction of therapeutic tactics. Therefore, the level of expression of miR-196a (<-1,75) may be an additional biomarker in the pathogenesis of HCV-infection, which can then be used in the monitoring and treatment of patients. Low expression of miR-196a may be the basis for prescribing more effective direct-acting antiviral therapy to patients and will allow personalizing therapeutic tactics in patients with chronic viral hepatitis C. Авторами представлено вивчення рівня експресії мікроРНК-196a у 74 хворих на хронічний вірусний гепатит С з 1-м генотипом HCV. Хворих було розподілено на дві групи залежно від попереднього досвіду противірусної терапії схемами, що містять інтерферон – 21 хворий, які мали невдачу після проведення противірусної терапії (група 1) та група порівняння (група 2) – 53 наївних пацієнти. Для вивчення рівня експресії мікроРНК-196a (miR-196a) використовувалося двоетапне дослідження згідно з протоколом виробника. Спочатку тотальну РНК виділяли з плазми крові методом фенол-хло-роформної екстракції. Потім виконували зворотну транскрипцію з використанням набору для зворотної транскрипції мікроРНК TaqMan® (Applied Biosystems, США), специфічних петльових праймерів до зрілої мікроРНК-196a та snRNA U6 (як ендогенного контрольного гена) і 10 нг загальної РНК. Кількісну ПЛР у реальному часі проводили з використанням аналізу мікроРНК TaqMan®. З метою оптимізації прогнозування відповіді на ПВТ та призначення оптимальних схем терапії для проблемних хворих з невдачами терапії схемами, що містять інтерферон, використано аналіз за допомогою ROC-кривих. Оцінено середній рівень експресії мікроРНК-196a у хворих на ХВГС (Me). Так, у 1-й групі пацієнтів він становив 0,011 (IQR: 0,002; 0,310) і в групі порівняння – 0,346 (IQR: 0,054; 1,239) при p=0,012 за критерієм U. Проведений ROC-аналіз показав, що досліджувана мікроРНК-196a може диференціювати пацієнтів з ХВГС з 1-м генотипом HCV, залежно від попереднього досвіду противірусної терапії, а саме, у хворих з невдачами терапії схемами, що містять інтерферон, та наївних пацієнтів - AUC=0,688 (95% CI 0,570–0,791; p=0,017), J=0,40, Se=57,14%, Sp=83,02%, ДЕ=70,08 пов'язаний критерій експресії miR-196a становив ≤0,0178 ум. од. та для Log10 miR-196a був <-1,75 ум. од., що в подальшому може бути використано для скринінгу і дає додаткові можливості для корекції лікувальної тактики хворим. Високоспецифічний критерій класифікатора експресії miR-196a становив ≤0,0017 ум. од. (Se=28,57%, Sp=98,11%, ДЕ=63,34%), що дає додаткові можливості для корекції лікувальної тактики хворим. Таким чином, рівень експресії мікроРНК-196a може бути додатковим біомаркером у патогенезі ХВГС, що в подальшому може бути застосовано при моніторингу і лікуванні хворих. Низький рівень експресії мікроРНК-196a, а саме ≤0,0017 ум. од. (Log10 <-2,78 ум. од.), може бути підґрунтям для призначення хворим більш ефективних схем терапії із застосуванням противірусних препаратів прямої дії та дозволить персоніфікувати лікувальну тактику у хворих на ХВГС.

Item Type:	Article
Additional Information:	https://doi.org/10.26641/2307-0404.2020.2.206387
Uncontrolled Keywords:	chronic viral hepatitis C, miR-196a, hsa-miRNA-196a, antiviral therapy. хронічний вірусний гепатит С, мікроРНК-196a, противірусна терапія.
Subjects:	Infectious diseases
Divisions:	Departments > Department of Infectious Diseases
Depositing User:	Анастасия Жигар
Date Deposited:	20 Jan 2021 13:18
Last Modified:	20 Jan 2021 13:18
URI:	http://repo.dma.dp.ua/id/eprint/6179

Actions (login required)

View Item