Генотип-асоційовані клінічні маркери розвитку атопічного фенотипу в дітей

Дитятковський, В.О. (2023) Генотип-асоційовані клінічні маркери розвитку атопічного фенотипу в дітей. Український журнал Перинатологія і Педіатрія = Ukrainian Journal of Perinatology and Pediatrics, 1 (93). pp. 45-50. ISSN 2707-1375 (Online), 2706-8757 (Print)

Text Дитятковський_Перінатологія і педіатрія_01_2023 (Скопус).pdf Download (335kB)

Abstract

Атопічний марш (АМ) виникає за лінійної прогресії атопічних хвороб (АХ) із фенотипу атопічного дерматиту (АД) до його комбінацій з іншими видами АХ: алергічним ринітом/ринокон’юнктивітом (АР/АРК) та бронхіальною астмою (БА). У патогенезі АХ важливу роль відіграє тимічний стромальний лімфопоетин (TSLP). Генотипи A/A, A/G і G/G SNV rs11466749 гена TSLP упродовж останніх десятиліть показали контраверсійні ролі у виникненні моно- та поліорганних фенотипів АМ у дітей. Мета — визначити асоціації та ризики виникнення фенотипів АМ у дітей при різних генотипах SNV rs11466749 гена TSLP. Матеріали та методи. До дослідження залучено 398 дітей віком від 3 до 18 років: 293 дитини — до основної; 105 — до контрольної групи. Пацієнти основної групи хворіли на АХ у шести різних фенотипічних варіантах АМ: «АД», «АР/АРК», «БА», «АД+АР/АРК», «БА+АР/АРК», «АД+АР/АРК+БА»; пацієнти контрольної групи хворіли на патологію шлунково-кишкового тракту. Пацієнтам усіх когорт проведено генотипування гена TSLP (rs11466749) методом полімеразної ланцюгової реакції в реальному часі. Для статистичної обробки отриманих результатів використано коефіцієнт контингенції Бравайса–Пірсона (rb), критерії Пірсона (c2), точний критерій Фішера (ТКФ), відношення шансів (ВШ) з 95% довірчим інтервалом (95% ДІ). Статистично достовірними прийнято результати за p≤0,05. Результати. Гомозиготний генотип А/А rs11466749 TSLP виявився достовірно найчастішим при фенотипах із моно- або олігоорганним ураженням «АР/АРК» та поліорганним ураженням «БА+АР/АРК» і «АД+АР/АРК+БА»: 66,2%, 65,3% і 76,9% відповідно (p<0,05). Гетерозиготний генотип A/G rs11466749 TSLP виявився другим за достовірністю і частотою: «АР/АРК» — 31,0% (p<0,05); «БА+АР/АРК» — 31,9% (p=0,05–0,1) і «АД+АР/АРК+БА» — 11,5% (p<0,05). Генотип А/А rs11466749 TSLP достовірно асоціювався і підвищував ризики розвитку трьох зазначених фенотипів АМ: «АР/АРК» — rb=0,156, ВШ=1,92 (95% ДІ: 1,03-3,58, p<0,05); «БА+АР/АРК» — rb=0,147, ВШ=1,84 (95% ДІ: 1,0-3,42, p<0,05); «АД+АР/АРК+БА» — rb=0,212, ВШ=3,27 (95% ДІ: 1,22–8,80, p<0,05). Генотип А/G rs11466749 TSLP достовірно асоціювався і мав протекторний вплив щодо розвитку визначених фенотипів АМ: «АР/АРК» — rb=0,148, ВШ=0,53 (95% ДІ: 0,28–1,0, p<0,05); «БА+АР/АРК» — rb=0,138, ВШ=0,55 (95% ДІ: 0,30–1,04, p=0,05–0,1); «АД+АР/АРК+БА» — rb=0,280, ВШ=0,15 (95% ДІ: 0,04–0,55, p<0,05). Висновки. Гомозиготний генотип А/А SNV rs11466749 гена TSLP достовірно підвищує ризик розвитку фенотипів АМ «АР/АРК», «БА+АР/АРК» і «АД+АР/АРК+БА», а гетерозиготний генотип A/G SNV rs11466749 гена TSLP має достовірний протекторний вплив стосовно їхнього розвитку в дітей. Дослідження виконано відповідно до принципів Гельсінської декларації. Протокол дослідження ухвалено Локальним етичним комітетом зазначеної в роботі установи. На проведення досліджень отримано інформовану згоду батьків дітей. Автор заявляє про відсутність конфлікту інтересів. Atopic march (AM) occurs as the linear progression of atopic disorders (AtD) from atopic dermatitis (AD) phenotype to its combinations with other AtD: allergic rhinitis/rhinoconjunctivitis (AR/ARC) and bronchial asthma (BA). Thymic stromal lymphopoietin (TSLP) plays an important role in AtD pathogenesis. Single nucleotide variant (SNV) rs11466749 of the TSLP gene during the last decades showed the controversial roles of A/A, A/G and G/G genotypes in occurrence of the mono— and polyorgan AM phenotypes in children. Purpose — to determine the associations and risks of AM phenotypes with homozygous or heterozygous SNV rs11466749 genotypes of the TSLP gene in children. Materials and methods. The study involved 398 children aged 3 to 18 years old: 293 children in the main group and 105 — in the control group. Patients of the main group suffered from AtD in 6 different AM phenotypes: «AD», «AR\ARC», «BA», «AD+AR/ARC», «BA+AR/ARC», «AD+AR/ARC+BA»; patients of the control group suffered from gastrointestinal pathology. Patients of all cohorts were genotyped for genotype variants A/A, A/G and G/G rs11466749 TSLP by the polymerase chain reaction in real time. Pearson’ contingency coefficient (rb), Pearson test (c2), Fisher’s exact test, odds ratio (OR) with a 95% confidence interval (95% CI) were used for statistical processing of the obtained results. Results at p≤0.05 were considered statistically significant. Results. The homozygous A/A rs11466749 TSLP genotype was significantly most frequent in phenotypes with mono- or oligoorgan affection «AR/ARC» and polyorgan affection «BA+AR/ARC» and «AD+AR/ARC+BA»: 66,2%, 65.3% and 76.9% respectively (p<0.05). Heterozygous genotype A/G rs11466749 TSLP was the second most significant and frequent: «AR/ARC» — 31.0% (p<0.05), «BA+AR/ARC» — 31.9% (p=0.05–0.1) and «AD+AR/ARC+BA» — 11.5% (p<0.05). Genotype A/A rs11466749 TSLP was significantly associated and increased the development risks of the 3 specified AM phenotypes: «AR/ARC» — rb=0.156, OR=1.92 (95% CI: 1.03–3.58, p<0.05); «BA+AR/ARC» — rb=0.147, OR=1.84 (95% CI: 1.0–3.42, p<0.05); «AD+AR/ARC+BA» — rb=0.212, OR=3.27 (95% CI: 1.22–8.80, p<0.05). Genotype A/G rs11466749 TSLP was reliably associated and had a protective effect on the development of bespoke AM phenotypes: «AR/ARC» — rb=0.148, OR=0.53 (95% CI: 0.28–1.0, p<0.05); «BA+AR/ARC2 — rb=0.138, OR=0.55 (95% CI: 0.30–1.04, p=0.05–0.1); «AD+AR/ARC+BA» — rb=0.280, OR=0.15 (95% CI: 0.04–0.55, p<0.05). Conclusions. The homozygous genotype A/A SNV rs11466749 of TSLP gene significantly increases the risk of developing AM phenotypes «AR/ARC», «BA+AR/ARC» and «AD+AR/ARC+BA», and the heterozygous genotype A/G SNV rs11466749 of TSLP gene possesses a significantly protective effect on their development in children. The research was carried out in accordance with the principles of the Helsinki Declaration. The study protocol was approved by the Local Ethics Committee of the participating institution. The informed consent of the patient was obtained for conducting the studies. No conflict of interests was declared by the author.

Item Type:	Article
Additional Information:	DOI: https://doi.org/10.15574/PP.2023.93.45
Uncontrolled Keywords:	діти, генотипи, тимічний стромальний лімфопоетин, атопічний марш, фенотипи. children, genotypes, thymic stromal lymphopoietin, atopic march, phenotypes.
Subjects:	Pediatrics
Divisions:	Departments > Department of Pediatrics 1 and medical genetics (formerly - Faculty Pediatrics and Medical Genetics)
Depositing User:	Анастасия Жигар
Date Deposited:	23 May 2023 12:51
Last Modified:	23 May 2023 12:51
URI:	http://repo.dma.dp.ua/id/eprint/8378

Actions (login required)

View Item